På sidste møde i koordinationsudvalget i forbindelse med BIOSAM
blev der spurgt til, hvor stort sammenfald, der er mellem svinegenomet og
det humane genom. Efter at have spurgt mig for på hjemmebanen hos forskningsleder
Christian Bendixen er her en uddybning. Christian Bendixen er DJF ansvarlig
for vort samarbejdsprojekt med Kina vedr. kortlægning af svinegenomet.
Som det ses er der forskel mellem regioner i genomet.
Ligheden mellem de humane gener og de tilsvarende svine gener er omkring
90% på DNA-niveau i de kodende regioner, på protein-niveau er
ligheden endnu større >95%. De data vi har analyseret er fortrinsvis
fra kodende regioner og vor viden omkring de ikke-kodende er endnu begrænset,
det ser dog ud til at variere stærkt fra område til område,
og det må forventes, at de områder, der er bedst bevarede muligvis
indeholder sekvenselementer med en eller anden vigtig (men endnu ukendt) funktion.
Således vil promoter regioner (promoteren er sekvensen i begyndelsen
af genet, der indeholder regulatoriske signaler, men de indgår ikke
i den kodende del af genet) være mere bevaret end områder, der
ligger langt væk fra egentlige gener. Jeg er overbevist om, at der i
visse af disse regioner er en sekvenslighed på omkring 60%, men et sådant
tal giver kun mening, hvis man specificerer, hvilket type "område"
(f.eks. kodende/ikke-kodende), man befinder sig i.
Ole Olsen, Foulum
